Search results
Title WarpSTR: Determining tandem repeat lengths using raw nanopore signals Author Sitarčík Jozef Co-authors Vinař Tomáš Brejová Broňa Krampl W. Budiš J. Radvánszky Ján SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Lucká Mária 1952- Action APVV-18-0319. Vývoj a testovanie molekulárnych a informatických metód na efektívnu charakterizáciu a interpretáciu klinicky relevantných mikrosatelitových repetitívnych motívov z genomických dát : 2019-2023 : Geneton : BMC SAV APVV-18-0239. Nekonvenčné aplikácie nových sekvenačných technológií v komparatívnej a funkčnej genomike : 2018- Source document Bioinformatics. Vol. 39, no. 6 (2023), bta d388 Category ADCA - Scientific papers in foreign journals registered in Current Contents Connect with IF (impacted) Category of document (from 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Type of document článok Year 2023 DOI 10.1093/bioinformatics/btad388 URL URL link File name Access Size Downloaded Type License WarpSTR-determining tandem repeat lengths using raw nanopore signals.pdf available 3.1 MB 4 Publisher's version WarpSTR Determining tandem repeat lengths using raw nanopore.pdf available 1.5 MB 5 Author's preprint 
article
Title VirPool: model-based estimation of SARS-CoV-2 variant proportions in wastewater samples Author Gafurov Askar Co-authors Baláž A. Amman Fabian Boršová Kristína SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Čabanová Viktória SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Klempa Boris 1976 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Bergthaler Andreas Vinař Tomáš Brejová Broňa Action APVV-18-0239. Nekonvenčné aplikácie nových sekvenačných technológií v komparatívnej a funkčnej genomike : 2018- Source document BMC Bioinformatics. Vol. 23, no. 1 (2022), art. no. 551 Category ADMA - Scientific papers in foreign impacted journals registered in Web of Sciences or Scopus Category of document (from 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Type of document článok Year 2022 DOI 10.1186/s12859-022-05100-3 URL URL link File name Access Size Downloaded Type License Virpool-model-based-estimation-of-SARS-CoV-2 variant proportions.pdf available 2.3 MB 3 Publisher's version article
Title Sequencing SARS-CoV-2 in Slovakia: An Unofficial Genomic Surveillance Report Author Brejová Broňa Co-authors Hodorová Viktória Boršová Kristína SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Čabanová Viktória SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Szemes Tomáš Mišík Matej Klempa Boris 1976 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Nosek Jozef Vinař Tomáš Source document CEUR Workshop Proceedings : ITAT 2021 - Information Technologies – Applications and Theory 2021 - 21st Conference Information Technologies - Applications and Theory : Data Analysis in Response to Epidemics (DARE 2021). Vol. 2962 (2021) Category AFD - Published papers from domestic scientific conferences Year 2021 URL URL link article
Title CEUR Workshop Proceedings : ITAT 2021 - Information Technologies – Applications and Theory 2021 - 21st Conference Information Technologies - Applications and Theory : Data Analysis in Response to Epidemics (DARE 2021) Another authors Brejová Broňa Ciencialová Lucie Holeňa Martin Mráz František Pardubská Dana Plátek Martin Vinař Tomáš Issue data 2021 Source document CEUR Workshop Proceedings. Vol. 2962 (2021) URL URL link References (3) Publication Activity of SAV - Articles 
book
Title Surveillance of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in Slovakia using a novel, multiplexed RT-qPCR assay Author Boršová Kristína SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Co-authors Paul D. Kováčová Viera Radvánszka Monika Hajdu Roman Čabanová Viktória SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Sláviková Monika 1970- SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Ličková Martina 1975 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Lukáčiková Ľubomíra 1984 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Belák Andrej 1979- SAVETNOL - Ústav etnológie a sociálnej antropológie SAV Roussier Lucia Kostičová Michaela Líšková A. Maďarová L. Štefkovičová Mária Reizigová Lenka Nováková Elena Sabaka P. Koščálová Alena Brejová Broňa Staroňová Edita Mišík Matej Vinař Tomáš Nosek Jozef Čekan Pavol Klempa Boris 1976 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Action APVV PP-COVID-20-0017. Výskum imunitnej odpovede na infekciu SARSCoV-2 a vývoj klinicky relevantných virologických testov na zvládnutie dopadov pandémie COVID19 : BMC SAV Source document Scientific Reports. Vol. 11, no. 1 (2021), art. no. 20494 Category ADCA - Scientific papers in foreign journals registered in Current Contents Connect with IF (impacted) Category of document (from 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Type of document článok Year 2021 DOI 10.1038/s41598-021-99661-7 URL URL link File name Access Size Downloaded Type License Surveillance of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in Slovakia using a novel, multiplexed RT-qPCR assay.pdf available 2.4 MB 9 Publisher's version article
Title A SARS-CoV-2 mutant from B.1.258 lineage with ∆H69/∆V70 deletion in the Spike protein circulating in Central Europe in the fall 2020 Author Brejová Broňa Co-authors Boršová Kristína SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Hodorová Viktória Čabanová Viktória SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Reizigová Lenka Paul D. Čekan Pavol Klempa Boris 1976 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Nosek Jozef Vinař Tomáš Action APVV PP-COVID-20-0017. Výskum imunitnej odpovede na infekciu SARSCoV-2 a vývoj klinicky relevantných virologických testov na zvládnutie dopadov pandémie COVID19 : BMC SAV Source document Virus Genes. Vol. 57, no. 6 (2021), p. 556–560 Category ADCA - Scientific papers in foreign journals registered in Current Contents Connect with IF (impacted) Category of document (from 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Type of document článok Year 2021 DOI 10.1007/s11262-021-01866-5 URL URL link article
Title Alternative Base Callers Aid Real-Time Analysis of SARS-CoV-2 Sequencing Runs Author Boža Vladimír Co-authors Fedor Matej Boršová Kristína SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Čabanová Viktória SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Černíková Jana Hodorová Viktória Perešíni Peter Sládečková Klára Klempa Boris 1976 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Nosek Jozef Brejová Broňa Vinař Tomáš Source document CEUR Workshop Proceedings : ITAT 2021 - Information Technologies – Applications and Theory 2021 - 21st Conference Information Technologies - Applications and Theory : Data Analysis in Response to Epidemics (DARE 2021). Vol. 2962 (2021) Category AFD - Published papers from domestic scientific conferences Year 2021 URL URL link article
Title Nanopore Sequencing of SARS-CoV-2: Comparison of Short and Long PCR-tiling Amplicon Protocols Author Brejová Broňa Co-authors Boršová Kristína SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Hodorová Viktória Čabanová Viktória SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Gafurov Askar Fričová Dominika SAVNEIMU - Neuroimunologický ústav SAV Vinař Tomáš Klempa Boris 1976 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Nosek Jozef Action APVV PP-COVID-20-0017. Výskum imunitnej odpovede na infekciu SARSCoV-2 a vývoj klinicky relevantných virologických testov na zvládnutie dopadov pandémie COVID19 : BMC SAV Source document PLoS ONE. Vol. 16, iss. 10 (2021), art. no. e0259277 Category ADMA - Scientific papers in foreign impacted journals registered in Web of Sciences or Scopus Category of document (from 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Type of document článok Year 2021 DOI 10.1371/journal.pone.0259277 URL URL link File name Access Size Downloaded Type License Nanopore Sequencing of SARS-CoV-2 COmParison of Short and Long PCR-tiling Amplicon Protocols.pdf available 3.2 MB 2 Publisher's version article
Title Študentská vedecká konferencia FMFI UK, Bratislava, 2018 : Zborník príspevkov Par.title Proceedings of the Student Science Conference 2018 Another authors Brejová Broňa Guričan Jaroslav Vinař Tomáš Action Študentská vedecká konferencia FMFI UK, Bratislava, 2018 : 25. apríl 2018 : Bratislava Issue data Bratislava : Knižničné a edičné centrum FMFI UK , 2018. - 315 s. Category FAI - Editorial work on book publications (bibliographies, encyclopedias, catalogues, dictionaries, collective publications/proceedings, atlases ...) References (3) Publication Activity of SAV - Articles book
Title Massive programmed translational jumping in mitochondria Author Lang B. Franz Co-authors Jakubková Michaela Hegedusová Eva Daoud Rachid Forget Lise Brejová Broňa Vinař Tomáš Kosa Peter Fričová Dominika Neboháčová Martina Griač Peter 1960- SAVBIOGE - Ústav biochémie a genetiky živočíchov SAV Tomáška Martin Burger Gertraud Nosek J. Source document Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Vol. 111, no 6 (2014) p. 5926-5931 Category ADCA - Scientific papers in foreign journals registered in Current Contents Connect with IF (impacted) Category of document (from 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Type of document článok Year 2014 DOI 10.1073/pnas.1322190111 article