Search results
Názov WarpSTR: Determining tandem repeat lengths using raw nanopore signals Autor Sitarčík Jozef Spoluautori Vinař Tomáš Brejová Broňa Krampl W. Budiš J. Radvánszky Ján SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Lucká Mária 1952- Akcia APVV-18-0319. Vývoj a testovanie molekulárnych a informatických metód na efektívnu charakterizáciu a interpretáciu klinicky relevantných mikrosatelitových repetitívnych motívov z genomických dát : 2019-2023 : Geneton : BMC SAV APVV-18-0239. Nekonvenčné aplikácie nových sekvenačných technológií v komparatívnej a funkčnej genomike : 2018- Zdroj.dok. Bioinformatics. Vol. 39, no. 6 (2023), bta d388 Kategória ADCA - Vedecké práce v zahraničných karentovaných časopisoch impaktovaných Kategória (od 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Typ výstupu článok Rok vykazovania 2023 DOI 10.1093/bioinformatics/btad388 URL URL link Názov súboru Prístup Veľkosť Stiahnuté Typ Licence WarpSTR-determining tandem repeat lengths using raw nanopore signals.pdf Prístupný 3.1 MB 4 Vydavateľská verzia WarpSTR Determining tandem repeat lengths using raw nanopore.pdf Prístupný 1.5 MB 5 Autorský preprint Názov VirPool: model-based estimation of SARS-CoV-2 variant proportions in wastewater samples Autor Gafurov Askar Spoluautori Baláž A. Amman Fabian Boršová Kristína SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Čabanová Viktória SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Klempa Boris 1976 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Bergthaler Andreas Vinař Tomáš Brejová Broňa Akcia APVV-18-0239. Nekonvenčné aplikácie nových sekvenačných technológií v komparatívnej a funkčnej genomike : 2018- Zdroj.dok. BMC Bioinformatics. Vol. 23, no. 1 (2022), art. no. 551 Kategória ADMA - Vedecké práce v zahraničných impaktovaných časopisoch registrovaných vo WOS Core Collection alebo SCOPUS Kategória (od 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Typ výstupu článok Rok vykazovania 2022 DOI 10.1186/s12859-022-05100-3 URL URL link Názov súboru Prístup Veľkosť Stiahnuté Typ Licence Virpool-model-based-estimation-of-SARS-CoV-2 variant proportions.pdf Prístupný 2.3 MB 3 Vydavateľská verzia Názov Sequencing SARS-CoV-2 in Slovakia: An Unofficial Genomic Surveillance Report Autor Brejová Broňa Spoluautori Hodorová Viktória Boršová Kristína SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Čabanová Viktória SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Szemes Tomáš Mišík Matej Klempa Boris 1976 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Nosek Jozef Vinař Tomáš Zdroj.dok. CEUR Workshop Proceedings : ITAT 2021 - Information Technologies – Applications and Theory 2021 - 21st Conference Information Technologies - Applications and Theory : Data Analysis in Response to Epidemics (DARE 2021). Vol. 2962 (2021) Kategória AFD - Publikované príspevky na domácich vedeckých konferenciách Rok vykazovania 2021 URL URL link Názov Surveillance of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in Slovakia using a novel, multiplexed RT-qPCR assay Autor Boršová Kristína SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Spoluautori Paul D. Kováčová Viera Radvánszka Monika Hajdu Roman Čabanová Viktória SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Sláviková Monika 1970- SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Ličková Martina 1975 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Lukáčiková Ľubomíra 1984 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Belák Andrej 1979- SAVETNOL - Ústav etnológie a sociálnej antropológie SAV Roussier Lucia Kostičová Michaela Líšková A. Maďarová L. Štefkovičová Mária Reizigová Lenka Nováková Elena Sabaka P. Koščálová Alena Brejová Broňa Staroňová Edita Mišík Matej Vinař Tomáš Nosek Jozef Čekan Pavol Klempa Boris 1976 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Akcia APVV PP-COVID-20-0017. Výskum imunitnej odpovede na infekciu SARSCoV-2 a vývoj klinicky relevantných virologických testov na zvládnutie dopadov pandémie COVID19 : BMC SAV Zdroj.dok. Scientific Reports. Vol. 11, no. 1 (2021), art. no. 20494 Kategória ADCA - Vedecké práce v zahraničných karentovaných časopisoch impaktovaných Kategória (od 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Typ výstupu článok Rok vykazovania 2021 DOI 10.1038/s41598-021-99661-7 URL URL link Názov súboru Prístup Veľkosť Stiahnuté Typ Licence Surveillance of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in Slovakia using a novel, multiplexed RT-qPCR assay.pdf Prístupný 2.4 MB 9 Vydavateľská verzia Názov A SARS-CoV-2 mutant from B.1.258 lineage with ∆H69/∆V70 deletion in the Spike protein circulating in Central Europe in the fall 2020 Autor Brejová Broňa Spoluautori Boršová Kristína SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Hodorová Viktória Čabanová Viktória SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Reizigová Lenka Paul D. Čekan Pavol Klempa Boris 1976 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Nosek Jozef Vinař Tomáš Akcia APVV PP-COVID-20-0017. Výskum imunitnej odpovede na infekciu SARSCoV-2 a vývoj klinicky relevantných virologických testov na zvládnutie dopadov pandémie COVID19 : BMC SAV Zdroj.dok. Virus Genes. Vol. 57, no. 6 (2021), p. 556–560 Kategória ADCA - Vedecké práce v zahraničných karentovaných časopisoch impaktovaných Kategória (od 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Typ výstupu článok Rok vykazovania 2021 DOI 10.1007/s11262-021-01866-5 URL URL link Názov Alternative Base Callers Aid Real-Time Analysis of SARS-CoV-2 Sequencing Runs Autor Boža Vladimír Spoluautori Fedor Matej Boršová Kristína SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Čabanová Viktória SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Černíková Jana Hodorová Viktória Perešíni Peter Sládečková Klára Klempa Boris 1976 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Nosek Jozef Brejová Broňa Vinař Tomáš Zdroj.dok. CEUR Workshop Proceedings : ITAT 2021 - Information Technologies – Applications and Theory 2021 - 21st Conference Information Technologies - Applications and Theory : Data Analysis in Response to Epidemics (DARE 2021). Vol. 2962 (2021) Kategória AFD - Publikované príspevky na domácich vedeckých konferenciách Rok vykazovania 2021 URL URL link Názov Nanopore Sequencing of SARS-CoV-2: Comparison of Short and Long PCR-tiling Amplicon Protocols Autor Brejová Broňa Spoluautori Boršová Kristína SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Hodorová Viktória Čabanová Viktória SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Gafurov Askar Fričová Dominika SAVNEIMU - Neuroimunologický ústav SAV Vinař Tomáš Klempa Boris 1976 SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Nosek Jozef Akcia APVV PP-COVID-20-0017. Výskum imunitnej odpovede na infekciu SARSCoV-2 a vývoj klinicky relevantných virologických testov na zvládnutie dopadov pandémie COVID19 : BMC SAV Zdroj.dok. PLoS ONE. Vol. 16, iss. 10 (2021), art. no. e0259277 Kategória ADMA - Vedecké práce v zahraničných impaktovaných časopisoch registrovaných vo WOS Core Collection alebo SCOPUS Kategória (od 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Typ výstupu článok Rok vykazovania 2021 DOI 10.1371/journal.pone.0259277 URL URL link Názov súboru Prístup Veľkosť Stiahnuté Typ Licence Nanopore Sequencing of SARS-CoV-2 COmParison of Short and Long PCR-tiling Amplicon Protocols.pdf Prístupný 3.2 MB 2 Vydavateľská verzia Názov Dante: genotyping of known complex and expanded short tandem repeats Autor Budiš J. Spoluautori Kucharík Marcel Ďuriš F. Gazdarica Juraj Zrubcová Michaela Ficek Andrej Szemes Tomáš Brejová Broňa Radvánszky Ján 1982- SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Akcia VEGA 2/0115/15. Štúdium možnej úlohy vybraných génov v molekulárnej patogenéze myotonickej dystrofie : 2015-2017 : BMC-UKTV Zdroj.dok. Bioinformatics. Vol. 35, no. 8 (2019), p. 1310-1317 Kategória ADCA - Vedecké práce v zahraničných karentovaných časopisoch impaktovaných Kategória (od 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Typ výstupu článok Rok vykazovania 2019 DOI 10.1093/bioinformatics/bty791 Názov Neuropeptide recognition by machine learning methods Autor Ridzik Andrej SAVINFO - Ústav informatiky SAV Spoluautori Brejová Broňa Zdroj.dok. ITAT 2014 : Information Technologies - Applications and Theory, Part I. P. 72-78. - Praha : Institute of Computer Science AS CR, 2014 / Kůrková Věra ; Bajer Lukáš ; Conference ITAT 2014 Information Technologies - Applications and Theory Kategória ADNB - Vedecké práce v domácich neimpaktovaných časopisoch registrovaných vo WOS Core Collection alebo SCOPUS Kategória (od 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Typ výstupu článok Rok vykazovania 2014 Názov Massive programmed translational jumping in mitochondria Autor Lang B. Franz Spoluautori Jakubková Michaela Hegedusová Eva Daoud Rachid Forget Lise Brejová Broňa Vinař Tomáš Kosa Peter Fričová Dominika Neboháčová Martina Griač Peter 1960- SAVBIOGE - Ústav biochémie a genetiky živočíchov SAV Tomáška Martin Burger Gertraud Nosek J. Zdroj.dok. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Vol. 111, no 6 (2014) p. 5926-5931 Kategória ADCA - Vedecké práce v zahraničných karentovaných časopisoch impaktovaných Kategória (od 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Typ výstupu článok Rok vykazovania 2014 DOI 10.1073/pnas.1322190111