Výsledky vyhľadávania
Názov SnakeLines: integrated set of computational pipelines for sequencing reads Autor Budiš J. Spoluautori Krampl W. Bohmer M. Szemes Tomáš Kucharík Marcel Lichvár M. Hekel R. Goga Adrián Sitarčík Jozef Smoľak D. Baláž A. Ďuriš F. Gazdarica Juraj Šoltys Katarína Turňa Ján Radvánszky Ján SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Zdroj.dok. Journal of Integrative Bioinformatics. Vol. 20, no. 3 (2023), art. no. 20220059 Kategória ADCA - Vedecké práce v zahraničných karentovaných časopisoch impaktovaných Kategória (od 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Typ výstupu článok Rok vykazovania 2024 DOI 10.1515/jib-2022-0059 URL URL link Názov súboru Prístup Veľkosť Stiahnuté Typ Licence SnakeLinesintegrated set of computational pipelines for sequencing reads.pdf Prístupný 1.9 MB 3 Vydavateľská verzia 
článok
Názov WarpSTR: Determining tandem repeat lengths using raw nanopore signals Autor Sitarčík Jozef Spoluautori Vinař Tomáš Brejová Broňa Krampl W. Budiš J. Radvánszky Ján SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Lucká Mária 1952- Akcia APVV-18-0319. Vývoj a testovanie molekulárnych a informatických metód na efektívnu charakterizáciu a interpretáciu klinicky relevantných mikrosatelitových repetitívnych motívov z genomických dát : 2019-2023 : Geneton : BMC SAV APVV-18-0239. Nekonvenčné aplikácie nových sekvenačných technológií v komparatívnej a funkčnej genomike : 2018- Zdroj.dok. Bioinformatics. Vol. 39, no. 6 (2023), bta d388 Kategória ADCA - Vedecké práce v zahraničných karentovaných časopisoch impaktovaných Kategória (od 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Typ výstupu článok Rok vykazovania 2023 DOI 10.1093/bioinformatics/btad388 URL URL link Názov súboru Prístup Veľkosť Stiahnuté Typ Licence WarpSTR-determining tandem repeat lengths using raw nanopore signals.pdf Prístupný 3.1 MB 4 Vydavateľská verzia WarpSTR Determining tandem repeat lengths using raw nanopore.pdf Prístupný 1.5 MB 5 Autorský preprint článok
Názov Combination of expert guidelines-based and machine learning-based approaches leads to superior accuracy of automated prediction of clinical effect of copy number variations Autor Sládeček Tomáš Spoluautori Gažiová M. Kucharík Marcel Zaťková Andrea 1971- SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Pös Zuzana SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Pos Ondrej Krampl W. Tomková Erika Hyblová Michaela Minárik Gabriel Radvánszky Ján SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Budiš J. Szemes Tomáš Akcia APVV-18-0319. Vývoj a testovanie molekulárnych a informatických metód na efektívnu charakterizáciu a interpretáciu klinicky relevantných mikrosatelitových repetitívnych motívov z genomických dát : 2019-2023 : Geneton : BMC SAV Zdroj.dok. Scientific Reports. Vol. 13 (2023), art. no. 10531 Kategória ADCA - Vedecké práce v zahraničných karentovaných časopisoch impaktovaných Kategória (od 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Typ výstupu článok Rok vykazovania 2023 DOI 10.1038/s41598-023-37352-1 URL URL link Názov súboru Prístup Veľkosť Stiahnuté Typ Licence Combination of expert guidelines‑based and machine.pdf Prístupný 2.8 MB 1 Vydavateľská verzia článok
Názov Automated prediction of the clinical impact of structural copy number variations Autor Gažiová M. Spoluautori Sládeček Tomáš Pos Ondrej Števko M. Krampl W. Pös Zuzana SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Hekel R. Hlavačka Mário Kucharík Marcel Radvánszky Ján SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Budiš J. Szemes Tomáš Akcia APVV-18-0319. Vývoj a testovanie molekulárnych a informatických metód na efektívnu charakterizáciu a interpretáciu klinicky relevantných mikrosatelitových repetitívnych motívov z genomických dát : 2019-2023 : Geneton : BMC SAV Zdroj.dok. Scientific Reports. Vol.12, no. 1 (2022), art. no. 555 Kategória ADCA - Vedecké práce v zahraničných karentovaných časopisoch impaktovaných Kategória (od 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Typ výstupu článok Rok vykazovania 2022 DOI 10.1038/s41598-021-04505-z URL URL link Názov súboru Prístup Veľkosť Stiahnuté Typ Licence Automated prediction of the clinical impact of structural.pdf Prístupný 6.5 MB 1 Vydavateľská verzia článok
Názov SnakeLines: integrated set of computational pipelines for paired-end sequencing reads Autor Krampl W. Spoluautori Budiš J. Kucharík Marcel Hekel R. Lichvár M. Smoľak D. Bohmer M. Baláž A. Ďuriš F. Gazdarica Juraj Šoltys Katarína Turňa Ján Radvánszky Ján 1982- SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Szemes Tomáš Akcia European society of human genetics conference ( 52nd : June 15-18, 2019 : Gothenburg, Sweden ) APVV-16-0264. Zvýšenie organoleptickej kvality vína aplikáciou nesacharomycétových koštartérov optimalizovanou na základe analýzy mikroflóry použitím NGS a analýzy arómy : 2017-2021 APVV-15-0232. Využitie sekvenovania novej generácie pre analýzu virómu medicínsky a hospodársky významných organizov : 2016-2019 : BMC Zdroj.dok. European Journal of Human Genetics. Vol. 27, suppl. 2 (2019), p. 1695-1695 Kategória AEMA - Abstrakty vedeckých prác v zahraničných impaktovaných časopisoch registrovaných vo WOS Core Collection alebo Kategória (od 2022) V3 - Vedecký výstup publikačnej činnosti z časopisu Typ výstupu abstrakt Rok vykazovania 2019 článok
Názov Computational method for the detection of microsatellite instability in tumor tissue samples - PB1054 : Cancer Posters Autor Budiš J. Spoluautori Sýkora M. Sládeček Tomáš Kucharík Marcel Krampl W. Pos Ondrej Styk J. Adamík T. Nemec Michal Lojová Ingrid SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Turňa Ján Radvánszky Ján SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Tomáš S. Akcia ASHG 2022 Annual Meeting : October 25-29, 2022 : Los Angeles APVV-18-0319. Vývoj a testovanie molekulárnych a informatických metód na efektívnu charakterizáciu a interpretáciu klinicky relevantných mikrosatelitových repetitívnych motívov z genomických dát : 2019-2023 : Geneton : BMC SAV Zdroj.dok. ASHG 2022 Annual Meeting Poster Abstracts. s. 170 : October 25-29 Kategória GII - Rôzne publikácie a dokumenty, ktoré nemožno zaradiť do žiadnej z predchádzajúcich kategórií Kategória (od 2022) O2 - Odborný výstup publikačnej činnosti ako časť knižnej publikácie alebo zborníka Typ výstupu poster z podujatia Rok vykazovania 2022 článok
Názov Massively parallel sequencing-based panel strategy for microsatellite instability testing - PB1152 : Cancer Posters Autor Styk J. Spoluautori Budiš J. Radvánszky Ján SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Kucharík Marcel Pos Ondrej Krampl W. Forgáčová Natália SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Sedláčková T. Janega Pavol 1978- Lojová Ingrid SAVBIOMED - Biomedicínske centrum SAV Adamík T. Nemec Michal Turňa Ján Repiská V. Szemes Tomáš Akcia ASHG 2022 Annual Meeting : October 25-29, 2022 : Los Angeles APVV-18-0319. Vývoj a testovanie molekulárnych a informatických metód na efektívnu charakterizáciu a interpretáciu klinicky relevantných mikrosatelitových repetitívnych motívov z genomických dát : 2019-2023 : Geneton : BMC SAV Zdroj.dok. ASHG 2022 Annual Meeting Poster Abstracts. s. 273 : October 25-29 Kategória GII - Rôzne publikácie a dokumenty, ktoré nemožno zaradiť do žiadnej z predchádzajúcich kategórií Kategória (od 2022) V2 - Vedecký výstup publikačnej činnosti ako časť editovanej knihy alebo zborníka Typ výstupu poster z podujatia Rok vykazovania 2022 článok